台湾大学许瑞祥教授的研究大致可分为三个阶段：1981～1989年，以形态分类、生化特性、交配育种研究灵芝，开发生产和研究用的菌株；1990～1999年，建构灵芝属的分子生物学监定系统；2000年迄今，以灵芝特殊基因的开发应用为主，将灵芝里的功能性蛋白和酵素单独开发应用。
整理／吴亭瑶
台湾大学许瑞祥教授受邀在中国福州市举办的《2016国际灵芝大会》上演讲。（摄影／吴亭瑶）
博士论文
许瑞祥。灵芝属菌株监定系统之研究。国立台湾大学农业化学研究所博士论文，1990。
灵芝相关之期刊论文
1. 许瑞祥、王西华。利用API-ZYM酵素分析系统进行灵芝属菌株分类之研究。中国农化会志，1986，24(2)：103-109。
2. 许瑞祥、王西华。利用单一双核菌株之交配反应进行灵芝属（Ganoderma）菌株类缘关系之研究。中国农业化学会志，1987，25(1)：119-124。
3. 许瑞祥、翁怡沁、王西华。利用人工培养菌株生长特性与不亲合性反应进行灵芝与松杉灵芝分类之结果。中国农化学会志，1988，26(4)：588-596。
4. 许瑞祥、陈芝莹、王西华。利用 Syringaldazine 测定灵芝属菌株细胞外漆氧化酶活性变化之研究。中国农化学会志，1989，27(1)：40-49。
5. 许瑞祥、陈芝莹、翁怡沁、王西华。利用漆氧化酶同功酵素电泳图谱进行灵芝属菌株分类之研究。中国农化学会志，1989，27(2)：209-217。
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指导灵芝相关的硕博士论
1. 杨秀菁。灵芝与松杉灵芝进行原生质体融合之研究。国立台湾大学农业化学研究所硕士论文，1992。
2. 王蕙芳。灵芝属锰超氧歧化酶基因之研究。国立台湾大学农业化学研究所硕士论文，1995。
3. 叶志新。灵芝属含锰超氧歧化酵素的纯化与定性。国立台湾大学农业化学研究所硕士论文，1996。
4. 赖志颖。灵芝属菌株锰过氧化酶的选殖与表达。国立台湾大学微生物与生化学研究所硕士论文，2005。
5. 戴意仁。灵芝属漆氧化酶基因选殖、分类与异源表现。国立台湾大学微生物与生化学研究所硕士论文，2005。
6. 陈嗣民。灵芝子实体萃取物对三氯化铝诱导大鼠大脑病变的作用。国立台湾大学生化科技学系博士论文，2014。
